Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGDCC3Q8IVU1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.1 ms