Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
WDR53Q7Z5U6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms