Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms