Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECW1Q76N89 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms