Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms