Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms