Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATL3Q6DD88 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms