Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNT1Q5JUK3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms