Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRT3Q5FWE3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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