Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms