Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms