Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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