Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms