Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC27Q2M243 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms