Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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COL24A1Q17RW2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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