Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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GEN1Q17RS7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GEN1Q17RS7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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