Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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