Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HIST3H3Q16695 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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