Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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HIF1AQ16665 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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