Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SNAPC1Q16533 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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