Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms