Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYCP1Q15431 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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