Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRKQ15262 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRKQ15262 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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