Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCLAFQ15004 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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