Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSPNQ14714 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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