Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms