Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNC3Q14003 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNC3Q14003 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNC3Q14003 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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KCNC3Q14003 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNC3Q14003 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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