Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAPSQ13938 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms