Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DDX39BQ13838 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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