Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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