Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HDAC1Q13547 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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