Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 C2-AS1-201ENST00000630806 762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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