Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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