Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO2Q13137 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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