Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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