Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2AQ12879 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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