Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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