Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TFCP2Q12800 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms