Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TWF1Q12792 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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