Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms