Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOX4Q06945 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms