Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms