Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACVR1Q04771 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACVR1Q04771 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms