Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms