Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PLOD1Q02809 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms