Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms