Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms