Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VLDLRP98155 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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