Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms