Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JAG1P78504 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JAG1P78504 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms